「妖怪祓い」とは、本来すむべき「隠世（かくりよ）」から、
何らかの事情で「現世（うつしよ）」に留まる妖怪たちを
「隠世」へと送り届ける仕事である。

妖怪祓いを行う物怪庵の主・安倍晴齋への
「100万怨」支払いのため、
奉公人として妖怪祓いの仕事を手伝うことになった
芦屋花繪。

ある日、2人が仕事を終えて物怪庵に戻ると、
隠世を統制する三権神の1人、
立法からのがSOS届く。

2人はすぐさま隠世を訪れるが、
そこで芦屋は事件に巻き込まれることに…。

芦屋と安倍の妖怪祓いコンビと妖怪たちの物語が
再び幕を開ける。